防潮濕
碳酸氫銨（ǎn）易吸濕，造成氮揮發損失；硝酸銨吸濕（shī）性很強（qiáng），易結塊、潮解；石灰（huī）氮和過磷酸鈣吸濕後易結塊，影響（xiǎng）施用效果。因此（cǐ），這些化肥應存放在幹燥、陰涼處，尤其（qí）碳酸氫銨儲存時包裝要密封牢固，避免與空氣（qì）接觸。
防揮發
氨（ān）水、碳酸氫銨極易揮發，儲存時要密封。氮素化肥、過磷酸鈣嚴禁與堿性物質（石灰、草木灰等）混合堆放，以防氮素化（huà）肥揮發損失和降低磷肥的肥效。
防受熱
溫度愈高，化肥的潮解揮發（fā）和結塊愈嚴重（穩定性愈差），因此貯存房屋的溫度（dù）應保持在30℃以下，農村好不（bú）放在有熱源（yuán）的廚（chú）房內。
防火（huǒ）災
硝酸銨、硝酸鉀等有助燃性，貯存時不能（néng）和易燃物如煤油（yóu）、汽油、秸（jiē）稈、木屑等堆放在一起，以免引起火災。
防爆炸
硝酸銨、硝酸鉀等容易爆炸，若與銅、鐵等金屬粉（fěn）末混在一起，一旦摩擦撞擊，就會引起爆炸事（shì）故。所以這些（xiē）化肥結塊硬化（huà）後，嚴禁用金屬物（wù）猛擊，要用重物碾碎。
防腐蝕
過（guò）磷酸鈣（gài）有腐（fǔ）蝕性，應防止與皮膚、金屬器具接（jiē）觸；氨水對銅、鐵有強烈腐蝕性，宜儲存於陶瓷、塑料、木製容器中。此外，化肥不能與種（zhǒng）子堆（duī）放在（zài）一（yī）起，也不（bú）要用化肥袋裝（zhuāng）種子（zǐ），以（yǐ）免影響種子發芽。
防混放（fàng）
化肥（féi）有酸性和堿性，應分門別（bié）類（lèi），按產地、種類、性質分（fèn）別（bié）放置和保管，以免降低肥效。
防誤用
肥料不能和農藥、人畜藥品、食用物品（如白糖、食鹽）等（děng）混放，以免誤用。特別要防止（zhǐ）小孩誤食。